به موجب مصوبه شصت و دومین جلسه شورای عالی برنامه‌­ریزی آموزش پزشکی مورخ  20 دی ماه 1394  با عنوان « تعدیل برنامه درسی و  آیین نامه دوره کارشناسی ارشد رشته آموزش پزشکی مجازی برای تسهیل و گسترش توانمندسازی اعضای هیات علمی» ، دوره کارشناسی ارشد آموزش پزشکی مجازی از سال 1395 توسط دانشگاه علوم پزشکی مجازی طراحی و ارائه شده است.

شایان ذکر است تعداد 14 نفر از دانشجویان دوره کارشناسی ارشد ناپیوسته رشته آموزش پزشکی مجازی موفق به دفاع پایان نامه و تعداد 8 نفر از دانشجویان  به عنوان دانش آموخته دوره فوق را با موفقیت به پایان رسانیده و به اخذ درجه کارشناسی ارشد نائل شده اند.  بدینوسیله توفیق دانش آموختگان را در توام نمودن علم با عمل و استفاده از دانش کسب شده در حوزه آموزش پزشکی در امر تدریس و تعلیم و تربیت آرزومند است.